Notes in V02 - Proteine und Proteinarchitektur I

To Subscribe, use this Key

Status	Last Update	Fields
Published	04/14/2024	Welche Aminosäuren sind bei neutralem pH-Wert gut wasserlöslich?{{c1::Alle, weil sie bei physiolgoischem pH-Wert Zwitterionen sind.}}
Published	04/14/2024	Was sind Aspartat und Glutamat?{{c1::Synonyme zu Asparaginsäure/ Glutaminsäure}}
Published	04/14/2024	Was wird bei der Ausbildung der Peptidbindung abgespalten?{{c1::Wasser - Kondensdation}}
Published	04/14/2024	Wie sieht die Peptidbindung aus und wie wird sie gebildet?{{c1::alpha-Aminogruppe einer AS mit alpha-Carboxylgruppe einer anderen ASdabei wird das C d…
Published	04/14/2024	In welche Richtung läuft die Translation ab?{{c1::Vom Amino-/ N-Terminus zum Carboxyl-/ C-Terminus}}
Published	04/14/2024	Was sind Oligopeptide?{{c1::Polymere aus 2 bis 10 AS}}
Published	04/14/2024	Wann spricht man von Polypeptiden?{{c1::lineare Polymere aus 10-50 AS}}
Published	04/14/2024	Ab welcher AS-Anzahl spricht man von Proteinen?{{c1::ab 50 Aminosäuren}}
Published	04/14/2024	Wie viele Peptidbindungen bildet jede AS in einem Polypeptid aus?{{c1::Je 2}}
Published	04/14/2024	Was gilt für die C=O bzw C=N Bindung der Peptidbidnung?{{c1::Die Elektronen sind delokalisiert. Dadurch ist die Peptidbindung starr und planar.Di…
Published	04/14/2024	Was bedeutet die pi-Bindung der Peptidbindung für die Peptide?{{c1::Dass sich die Bindungen nicht frei drehen können. Sie liegen in einer Ebene.Damit …
Published	04/14/2024	Was bildet das Rückgrat der Proteine?{{c1::Die planaren Peptidbindungen, die die Bewegung (Drehbarkeit) der Peptidkette einschränken.}}
Published	04/14/2024	Worum können sich die Peptide der Polypeptide drehen?{{c1::Nur um das Calpha-Atomes sind auch, je nach Seitenkette, nur bestimmte Winkel möglich}}
Published	04/14/2024	Was gilt für die Drehbarkeit von Glycin in Polypeptiden?{{c1::Es erhöht die Felxibilität der Peptidkette(aufgrund des H-Rests, der wenig Raum einnimmt…
Published	04/14/2024	In welche Konformation liegen die Peptidbindungen vor?{{c1::trans!!!außer Prolin -  es kann auch cis-Konformation eingehen (Prolin dreht sich dur…
Published	04/14/2024	Was sind die Sekundärstrukturelemente?{{c1::Räumliche Organisation benachbarter Aminosäuren (ca. 10-30)}}
Published	04/14/2024	Was machen die Sekundärstrukturelemente?{{c1::Sie Stabilisieren das Polypeptid}}
Published	04/14/2024	Welche Sekundärstrukturelemente gibt es?{{c1::alpha-Helix oder Beta-Faltblatt und random coils}}
Published	04/14/2024	Welche Bindungen führen zur Ausbildung der Sekundärstruktur?{{c1::Wasserstoffbrückenbindugnen zwischen C=O und N-H der Peptidbindungen}}
Published	04/14/2024	Was sind die Bindungsverhältnisse in der alpha Helix?{{c1::Wasserstoffbrücken zwischen den funktionellen Gruppen von zwei Aminosäuren, die von je drei…
Published	04/14/2024	Was genau ist die Struktur der alpha Helix?{{c1::eine rechtsgängie Helix - die Seitenketten zeigen nach außen}}
Published	04/14/2024	Wozu braucht man die alpha Helices?{{c1::wenn die Reste (die nach außen zeigen) hydrophob sind bilden sie oft Transmembrandomänen(Hydrophobes Milieu i…
Published	04/14/2024	Gruppen welcher Peptidbindungen bilden im Beta-Faltblatt eine Wasserstoffbrücke aus?{{c1::Einfach benachbart, keine besondere Regelmäßigkeit}}
Published	04/14/2024	Was gilt für die Stränge im Beta-Faltblatt?{{c1::Sie können antiparallel oder parallel sein, sie sind nicht unbedingt aus kontinuierlichen Segmenten a…
Published	04/14/2024	Wohin zeigen die Seitenketten im Beta-Faltblatt?{{c1::Abwechselnd nach oben und nach untender Polypeptidstrang bildet eine Zickzack-Kurve (ein gefalte…
Published	04/14/2024	Was ist die Beta-Schleife?{{c1::Der Teil des beta-Faltblattes, in dem der Polypeptidstrang eine 180°-Wende macht}}
Published	04/14/2024	Was macht die Beta-Schleife?{{c1::verbindet zB 2 Strangelemente des Beta-Faltblattes(auf kurzmöglichstem Weg.)}}
Published	04/14/2024	Zwischen den Gruppen welcher Peptidbindungen werden die Wasserstoffbrücken der Beta-Schleifen ausgebildet?{{c1::2 Aminosäuren Abstandn und n+3}}
Published	04/14/2024	Was sind die "random coils" ?{{c1::Sekundärstrukturelemente, die weder alpha-Helix noch Beta-Faltblatt klar zugeordnet werden könnenTrotzdem spezifisc…
Published	04/14/2024	Wie werden "random coils" stabilisiert?{{c1::Wasserstoffbrücken, VdWW und Ionenbindungen}}
Published	04/14/2024	Welche Aminosäure ist für die "random coils" maßgeblich?{{c1::Prolines passt wegen der Ringstruktur schlecht in alpha-H und beta-FB, kann als Struktur…
Published	04/14/2024	Was sind die verschiedenen Darstellung der Proteinstrukturen?{{c1::Kalottenmodell (jedes einzelne Atom mit Größe)Kugel-Stab-Modell (jedes einzelne Ato…
Published	04/14/2024	Was entscheidet über die Sekundärstruktur und Faltung des Polypeptids?{{c1::Die Aminosäuresequenz - die PrimärstrukturAS "präferieren" alpha-Helix ode…
Published	04/14/2024	Was ist die Tertiärstruktur?{{c1::die kompakte, durch Faltung erreichte, dreidimensionale Anordnung des Proteins}}
Published	04/14/2024	Welche Wechselwirkungen sind für die Tertiärstruktur verantwortlich?{{c1::nicht kovalente WW + Disulfidbrückenionische Bindungen (Salzbrücken)VWW-Kräf…
Published	04/14/2024	Was ist der hydrophobe Effekt der Tertiärstruktur der Proteine?{{c1::Unpolare Gruppen meiden das Wasser und bilden den hydrophoben Kern der Strukturen…
Published	04/14/2024	Was sind die einzigen kovalenten Interaktionen bezogen auf die Tertiärstruktur?{{c1::Die Disulfidbrücken}}
Published	04/14/2024	Worauf beruhen die Intermolekularen Wechselwirkungen zwischen Protein und Ligand?{{c1::Auf chemischer und struktureller KomplementaritätBeispiel unpol…
Published	04/14/2024	Worauf beruht der hydrophobe Effekt der Tertiärstruktur der Polypeptide?{{c1::1. Unpolare Gruppen meiden Wasser und bilden hydrophoben Kern der Strukt…
Published	04/14/2024	Was ist die Quartärstrukur der Proteine?{{c1::Anordnung mehrerer Polypeptidketten zu einem großen Komplex, um ein Oligomer zu bilden}}
Published	04/14/2024	Welche Bindungen stabilisieren die Quartärstruktur der Proteine?{{c1::Die selben, die auch die Tertiärstruktur stabilisieren(VdWW, H-Brücken, Salzbrüc…
Published	04/14/2024	Was sind Homomere bzw Heteromere der Quartärstrukur der Proteine?{{c1::Wenn die Quartärstruktur aus unterschiedlichen (Hetero-) bzw identischen (Homo-…
Published	04/14/2024	Wie nennt man Polypeptide, die keine Quartärstrukut besitzen, bzw nicht in ihrer Quartärstrukutr vorliegen?{{c1::Monomere / Untereinheiten}}
Published	04/14/2024	Wie nennt man Polypeptide, deren Quartärstruktur aus 2, 3, 4, ... Monomeren besteht?{{c1::Homo-/ Hetero-     Dimer, Trimer, Tetramer, P…
Published	04/14/2024	Wie sind die unterschiedlichen Proteinstrukturen organisiert?{{c1::Hierarchie der ProteinstrukturenKonformation (dreidimensionale Anordnung der Atome …
Published	04/14/2024	Was sind Domänen in den Polypeptiden?{{c1::Teilbereiche bzw selbstständige Tertiärstruktureinheiten mit spezifischen Funktionen}}
Published	04/14/2024	Wie läuft die alpha-beta-gamma-... Benennung der C-Atome in einer Aminosäure ab?{{c1::Man zählt einfach durch, alpha immer das selbe (C neben Carboxyl…
Published	04/14/2024	Was sind posttranslationale Modifikationen?{{c1::Modifikationen der Polypeptide nach der Translation}}
Published	04/14/2024	Welche posttranslationale Modifikationen sind denkbar (Wo?)?{{c1::Modifikationen am N- und C-Terminus und Modifizierung der Seitenketten}}
Published	04/14/2024	Welche posttranslationale Modifikationen am N- und C-Terminus sind denkbar?{{c1:: Formylierung, Acetylierung}}
Published	04/14/2024	Welche posttranslationale Modifikationen an den Seitenketten sind denkbar?{{c1::durch...kleine anorganische funktionelle GruppenzB Phosphorylierung, H…
Published	04/14/2024	Was ist neben der Addition von fkt Gruppen noch als posttranslationale Modifikation denkbar?{{c1::Ausbildung von Disulfidbrücken zw. gleichen/ untersc…
Published	04/14/2024	Was sind Liganden?{{c1::Moleküle, die von Proteinen erkannt und gebunden werdenzB Zucker, Nukleotide, Lipide, Aminosäuren, andere Proteine, etc}}
Published	04/14/2024	Was sind drei grundlegende Prinzipien der Enzymkatalysen?{{c1::Substrat-, Stereo- und Wirkungsspezifität}}
Published	04/14/2024	Was ist die Bindungsstärke eines Proteins qualitativ?{{c1::Ein Maß für die Affinität eines Proteins, einen bestimmten Liganden zu binden}}
Published	04/14/2024	Was gilt für die Affinität in Abhängigkeit von der Dissoziationskonstante KD?{{c1::Je kleiner die Dissoziationskonstante KD desto höher die Affinität}…
Published	04/14/2024	Was ist die halbmaximale Sättigung?{{c1::Ligandenkonzentration, bei der 50% der Bindungsstellen des Proteins besetzt sindentspricht dem KD-Wert!}}
Published	04/14/2024	Wie ist die Bindungsstärke eines Proteins zu einem bestimmten Ligand quantitativ beschrieben?{{c1::Über die Dissoziationskonstante KDSie ist die Gleic…
Published	04/14/2024	Auf welchen WWK beruht die Ligand-Protein-Bindung?{{c1::ionische WWK, VWW-Kräfte, Wasserstoffbrückenbindungen}}
Published	04/14/2024	Was ist die alternative Variante der Protein-Ligand-Bindung im vgl. zum Schlüssel-Schloss-Prinzip?{{c1::Das Prinzip des induced fites beschreibt eine …
Published	04/14/2024	Wie kann das Prinzip des induced fit anhand des Calmodulins (CaM) erklärt werden?{{c1::Das CaM besitzt 4 Ca2+-Bindungsstellenbei hoher Ca-Konzentratio…
Published	04/14/2024	Was ist der allosterische Effekt?{{c1::Wenn Proteine mehrere Liganden-Bindestellen besitzen. Diese sind räumlich getrennt. Sie "kommunizieren" miteina…
Published	04/14/2024	Wie kann das Prinzip der Allosterie am Hämoglobin erklärt werden?{{c1::kooperative Sauerstoffbeladung bewirkt Strukturveränderung, weswegen die Bindun…
Published	04/14/2024	Was sind Rückkopplungen?{{c1::Wenn Produkte / Substrate von Reaktionen ihre eigene Synthese bzw. ihren eigenen Abbau beeinflussenneg./ pos.}}
Published	04/14/2024	Wann werden Allosterische Effekte zB relevant?{{c1::Beim Hämoglobin, bei Rückkopplungen oder bei integralen Membranproteinen: SignaltransduktionHuber:…
Published	04/14/2024	Was genau ist die posttranslationale Phosphorylierung?{{c1::Die Übertragung vom Phosphat eines ATP's auf einen Serin-, Threonin- oder Tyrosinrest durc…
Published	04/14/2024	Was bewirken posttranslationale Modifikationen allgemein?{{c1::Konformationsänderungen, In-/Aktivierung oder Oberflächenveränderung der Proteine, soda…
Published	04/14/2024	Woran passen sich Proteine bzw Enyzme an?{{c1::An die zellulären bzw. metabolischen BedürfnisseSignale werden aufgenommen und bewirken eine Reaktion -…
Published	04/14/2024	Was sind Enzyme?{{c1::Proteine, die Substrate binden und ihre Reaktion katalysieren, indem sie die Aktivierungsenergie herabsetzen (Stabilisierung von…
Published	04/14/2024	Was sind Substrate?{{c1::Liganden, die an Enzymem binde}}
Published	04/14/2024	Wie nennt sich die Substratbindestelle der Enzyme?{{c1::aktives Zentrum}}
Published	04/14/2024	Was kann die Substratbindung am Enzym verursachen?{{c1::Konformationsänderungen (induced fit)um zB Substrate richtig anzuordnen, entsprechendes Milieu…
Published	04/14/2024	Wie werden die Substrate im aktiven Zentum der Enzyme positioniert{{c1::So, dass eine Reaktion optimal stattfinden kann}}
Published	04/14/2024	Was sind typische KD-Werte?{{c1::nano- bis millimolarer Bereich}}
Published	04/14/2024	Wovon wird die Halb-Maximale Sättigung quantitativ angegeben?{{c1::Von der Dissoziationskonstante KD}}
Published	04/14/2024	Aus wie vielen konsekutiven Aminosäuren besteht ein beta-Strang i.d.R.?{{c1::unterer 2 stelliger Bereich}}
Published	04/14/2024	Was sind random coils?{{c1::Sekundärstrukturelemente, die weder der alpha-Helix, noch dem beta-Faltblatt zuzuorndne sind}}
Status	Last Update	Fields