Notes in V2_Struktur der DNA

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Published	04/14/2024	Worauf wird die Methylgruppe bei der Protein-Methylierung übertragen? (auf welche Aminosäuren?){{c1::Lysin und Arginin (basische AS)}}
Published	04/14/2024	Was ist der Cofaktor der Protein-Methylierung?{{c1::SAM}}
Published	04/14/2024	Wie wird dem SAM bei der Protein-Methylierung die Methylgruppe abgezogen?{{c1::Nucleophile Substitution (kann enzymatisch bedingt sein)}}
Published	04/14/2024	Was bewirkt die variierte chemische Komplementarität durch posttranslationale Modifikation?{{c1::1) Oberflächenveränderung (neue Protein-WW, Aviditäts…
Published	04/14/2024	Was genau meint chemische Komplementarität?{{c1::Je besser und mehr WW ausgebildet werden, desto höher die chem. Komplementarität}}
Published	04/14/2024	Was also ist das Grundprinzip intra- und extrazellulärer Kommunikation?{{c1::chem. Komplementarität}}
Published	04/14/2024	Wozu führt die Methylierung von Lysin?{{c1::hydrophobizität steigt mit weiteren MethylierungenLadung am N bleibt erhaltenIMWW werden inhibiert (i…
Published	04/14/2024	Wie wird Lysin methyliert?{{c1::}}
Published	04/14/2024	Inwiefern können PTM Protein-Protein WW verändern?{{c1::Verlust von WWNeubildung von WW durch Änderung der Hydrophobizität, Konformationsänderung…
Published	04/14/2024	Was folgt aus der PTM?{{c1:: Regulation von physiologischen Prozessen in der ZelleEntscheidung über das Verhalten von Zellen (z.B. Proliferation,…
Published	04/14/2024	Was kennzeichnet die Primärstruktur der DNA?{{c1::Phosphodiesterbindung5´-3´ OrientierungAntiparallelitätHochsymmetrisch}}
Published	04/14/2024	Wie ordnet sich die DNA 3D an?{{c1::in einer rechtsgängigen Doppelhelixkleine und große Guben=> Zucker-Phosphat-Rückgratt nicht symmetrisch=> gr…
Published	04/14/2024	Welche Basen der DNA paaren sich?{{c1::A/T: 2 H-BB  C/G: 3 H-BB}}
Published	04/14/2024	Wie findet zellulärer Informationstransfer statt?{{c1::OrganisationNutzung - Transkription (DNA=>RNA)- RNA-Prozessierung (hnRNA=>mRNA)&nbsp…
Published	04/14/2024	Wie sieht ein Chromosom aus?{{c1::}}
Published	04/14/2024	Was ist die SKY?{{c1::spektrale Karyotypanalyse}}
Published	04/14/2024	Was ist die SKY durch FISH? Was sind die Bedingungen?{{c1::spektrale Karyotypanalyse durch Fluorescent in situ hybridization->Die Basensequenz…
Published	04/14/2024	Wie wird die SKY durch FISH realisiert?{{c1::Aufbrechen des DNA-Doppelstrangs durch Denaturierung}}
Published	04/14/2024	Wie stellt sich die SKY durch FISH in der Petrischale dar?{{c1::}}
Published	04/14/2024	Welche Chromosomen werden in Karyogrammen generell dargestellt?{{c1::mitotisch - verdichtet}}
Published	04/14/2024	Inwiefern können SKYs in der Diagnostik helfen? Welche Beispiele gibt es{{c1::nummerische und strukturelle Chromosmenaberrationen sichtbar ->T…
Published	04/14/2024	Wie sieht das humane Genom in der Interphase aus im SKY aus?{{c1::Chromatin: im gesamten Zellkern verteiltChromoaomen: nicht zufällig verteilt (bestim…
Published	04/14/2024	Was sind die Kondensationsstufen des Chromatins?{{c1::Chromatin-> Nucleosom (core Histone + 2 DNA-Schlaufen) -> dicht gepackte Nucleosomen ->…
Published	04/14/2024	Wie ist das beads-on-a-string aufgebaut?{{c1::Nukleosom + linker DNA}}
Published	04/14/2024	Wie ist das Nukleosom aufgebaut?{{c1::2xH2A2xH2B2xH32xH4->Varianten von Core-Histone durch PTM möglich}}
Published	04/14/2024	Was sind die Histone tails? Was ist möglich?{{c1::ca.20-40 AS am N-Terminus von Histonen ->posttranslationale Modifikationen->Protein-Protein We…
Published	04/14/2024	Inwiefern trägt das SAM zur Methylierung von Proteinen bei? Als was fungiert SAM?{{c1::Es ist das Cosubstrat, welches die Methylgruppe spenden kann}}
Published	04/14/2024	Durch welche Enzyme wird Lysin methyliert?{{c1::Lysin-Methylasen (KMT)}}
Published	04/14/2024	Durch welche Enzyme wird Lysin demethyliert?{{c1::Lysin-Demethylasen (KDM)}}
Published	04/14/2024	Wie oft kann Lysin methyliert werden? Wie nennt man die Produkte?{{c1::bis zu drei mal - Mono-/Di-/Trimethyl-Lysin (Kme1/2/3)}}
Published	04/14/2024	Was passiert mit zunehmender Methylierung des Lysins?{{c1::Hydrophobizität nimmt zu->Ionische WW sind erschwert->VWW ermöglicht}}
Published	04/14/2024	Inwiefern üben PTM proteinregulatorische Wirkung aus?{{c1::AbbauLokalisierung und subzelluläre Verteilungveränderte enzymatische AktivitätKomplexbildu…
Published	04/14/2024	Wozu führen PTM allgemein? Wozu kann dies weiter führen?{{c1::Oberflächenveränderung bzw. Konformationsänderung=>Alte Protein-Protein WW gehen verl…
Published	04/14/2024	Welche PTM sind am Arginin denkbar?{{c1::Methylierung}}
Published	04/14/2024	Welche PTM sind am Asparagin denkbar?{{c1::Glykosylierungen}}
Published	04/14/2024	Welche PTM sind am Cystein denkbar?{{c1::Disulfid-Brücken}}
Published	04/14/2024	Welche PTM sind am Histidin denkbar?{{c1::Phosphorylierung}}
Published	04/14/2024	Welche PTM sind am Methionin denkbar?{{c1::Acetylierung (am N-Terminus)}}
Published	04/14/2024	Welche PTM sind am Tyrosin denkbar?{{c1::Phosphorylierung}}
Published	04/14/2024	Welches Enzym katalysiert die Methylierung der Lysine  der histone tails?{{c1::Histon-Methyltransferase (HMT)}}
Published	04/14/2024	Welche Modifikationen sind beim Lysin möglich?{{c1::AcetylierungMethylierungUbiquitinierung}}
Published	04/14/2024	Welche Modifikationen sind beim Serin möglich?{{c1::Glykosylierung, Phosphorylierung}}
Published	04/14/2024	Welche Modifikationen sind beim Threonin möglich?{{c1::Glykosylierung, Phosphorylierung}}
Published	04/14/2024	Welche funktionelle Gruppe befindet sich am freien 3´Ende?{{c1::OH-Gruppe}}
Published	04/14/2024	Was versteht man unter einer kleinen und großen Grube?{{c1::Zucker-Phosphat-Rückgratt nicht symmetrisch->Entstehung von großer und kleiner Grube=&g…
Published	04/14/2024	Eine {{c1::Deletion}} ist das vollständige Fehlen eines Chromosomenfragments
Published	04/14/2024	Eine {{c1::Insertion}} ist das Vorhandensein eines zusätzlichen Chromosomenfragments
Published	04/14/2024	Eine {{c1::Inversion}} ist das spiegelverkehrte Einbauen von Chromosomenfragmenten
Published	04/14/2024	Eine {{c1::Copy-Number-Variante}} ist das mehrfache Vorhandensein eines Chromosomenfragments
Published	04/14/2024	Eine {{c1::Segmental-Duplication}} ist das doppelte Vorhandensein einer Gensequenz
Published	04/14/2024	Für was sind die Hox-Gene verantworlich?{{c1::Segmentierung->Regulation des Entwicklungsprozesses->Identität eines Segments}}
Published	04/14/2024	In welchen Regionen findet man weniger Repeats (repetitive Elemente)? Woran liegt das?{{c1::Genclustern->korrekte zeitliche und örtliche Regulation…
Published	04/14/2024	{{c1::Condensate}} sind eine entsprechende Region im Zellkern
Published	04/14/2024	Was versteht man unter einem SNP?{{c1::single nucleotid polymorphism=>führt zu anderen Ausprägungen des Phänotyps}}
Published	04/14/2024	PhD-Finger erkennen {{c1::hydrophobe Taschen (Kme3-Domäne)}}
Published	04/14/2024	Die DNA-Helix ist {{c1::rechtsgängig}}
Published	04/14/2024	Chromatin kann als {{c1::Euchromatin}} oder {{c1::Heterochromatin}} vorliegen
Published	04/14/2024	Condensate sind {{c1::Substrukturen}} im Zellkern und optimieren {{c1::biochemische Vorgänge}}
Published	04/14/2024	Linker DNA ist ca. {{c1::10-50bp}} lang, ein Nucleosom inklusive linker DNA ca. {{c1::200bp}} lang, d.h. {{c1::75-90%}} der DNA sind in Chromosomen ve…
Published	04/14/2024	Das Nucleosom ist {{c2::beweglich}}; fördert den {{c1::Auf-und Abbau}} sowie {{c1::Verschiebungen}}
Published	04/14/2024	Was sind transposable Elemente?{{c1::mobile DNA-/RNA-Abschnitte im Genom, die durch Transposition ihren Standort ändern können}}
Published	04/14/2024	Welche beiden transpoablen Elemente gibt es?{{c1::DNA-Intermediate, RNA-Intermediate}}
Published	04/14/2024	Welches Enzym katalysiert die Transposition von DNA-Intermediaten?{{c1::Recombinase oder Transposase}}
Published	04/14/2024	Wo sind DNA-Intermediate aktiv?{{c1::Fruchtfliegen, Zebrafische=>in der Primatenlinie das letzte mal vor ca. 37 Mio Jahren}}
Published	04/14/2024	Wie werden RNA-Intermediate in die DNA integriert?{{c1:: Reverse Transkription aus Retrotransposons oder endogenen Retroviren}}
Published	04/14/2024	Das einzig aktive Retrotransposon ist {{c1::LINE1}}
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